heat map圖怎么做？不會(huì)編程也能自己繪制heatmap！

做轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的客戶經(jīng)常需要把自己關(guān)注的功能或通路相關(guān)的基因繪制heatmap熱圖，或者不滿意公司提供的紅紅綠綠的heatmap圖。如果您想通過(guò)R語(yǔ)言包等繪制heatmap圖，可以看一下我們前面分享的畫圖專題|熱圖函數(shù)pheatamp()。

heat map圖怎么做？對(duì)于一看代碼就頭疼的，只好另辟蹊徑。今天，給大家介紹一個(gè)不需要編程基礎(chǔ)，甚至不需要下載軟件的在線熱圖繪制工具。

1、小編首推的還是百邁客的云平臺(tái)小工具，簡(jiǎn)單易用。

小工具網(wǎng)址：

https://international.biocloud.net/zh/software/tools/detail/small/305

輸入文件示例：

可選的配色方案也比較多，基本能滿足我們的需求：

軟件輸出結(jié)果示例：

2、百邁客云平臺(tái)繪圖工具包中的熱圖工具

https://console.biocloud.net/static/index.html#/drawtools/intoDrawTools/heatmap/input

輸入文件與設(shè)置同上一個(gè)工具類似，只是其配色支持自定義，且支持預(yù)覽：

預(yù)覽效果圖滿意后，即可下載繪圖結(jié)果：

3、heat map圖怎么做？推薦第三個(gè)方法：安裝軟件HemI。

該軟件下載地址：http://hemi.biocuckoo.org/down.php，即可下載安裝包（HemI_windows_1_0_win32_x64）和使用說(shuō)明書。

A: 列標(biāo)題。B: 行標(biāo)題。C: 行聚類效果。D: 列聚類效果。E: 顏色標(biāo)尺。F: 畫布大小(像素)。G: A (頂部)/D (底部) 的高度和B (左側(cè))/C (右側(cè))的寬度。(像素)

H: 對(duì)橫縱坐標(biāo)標(biāo)題（行標(biāo)題，列標(biāo)題）的設(shè)置，包括位置、字體。

I: 是否對(duì)行/列進(jìn)行聚類。

J: 旋轉(zhuǎn)設(shè)置, X-axis:列標(biāo)題文字的旋轉(zhuǎn)角度(A), Y-axis: 行標(biāo)題文字的旋轉(zhuǎn)角度(B),

Graph: 畫布的旋轉(zhuǎn)角度(例如，旋轉(zhuǎn)90°，將橫縱坐標(biāo)切換)。

K: 設(shè)置heatmap的色系。

L: 各項(xiàng)命令。無(wú)論您更改了什么設(shè)置，需要點(diǎn)擊“REFRESH”按鈕才會(huì)生效。

也就是您可以每更新完一項(xiàng)參數(shù)，都可以REFRESH后看效果，效果滿意后即可下載。

點(diǎn)擊L框中的LOAD按鈕即可打開(kāi)要生成heatmap的文件，excel格式也可以。X-axis title是選擇橫軸坐標(biāo)對(duì)應(yīng)到輸入文件的哪一行，選擇auto select自動(dòng)選擇矩陣數(shù)據(jù)。

點(diǎn)擊K框中的set按鈕，可以自定義顏色（舊版是customized）。

定義顏色標(biāo)尺連續(xù)或不連續(xù)，右鍵Set up bar；Set up statistic: 設(shè)置繪制此熱圖使用到的數(shù)學(xué)上的屬性（歸一化和聚類方法），一般二代數(shù)據(jù)選擇對(duì)數(shù)歸一化方式。

 

該軟件還可以設(shè)置熱圖到邊距的距離，相當(dāng)于調(diào)整行列的寬度，大家可以自行摸索下，簡(jiǎn)單易用。