時空組學(xué)研究前沿進(jìn)展【第1期】

作物泛單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組

期刊：Nature

IF：64.8

時間：2023年5月

DOI：10.1038/s41586-023-06053-0

研究對三種草本作物–玉米、高粱和狗尾草的根進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序。結(jié)果表明：部分細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組擁有更快的分化速度；全基因組復(fù)制事件提供了豐富的變異區(qū)域，促進(jìn)了細(xì)胞類型的快速進(jìn)化。細(xì)胞間保守的表達(dá)模式證明細(xì)胞類型進(jìn)化能介導(dǎo)作物產(chǎn)生優(yōu)良農(nóng)藝性狀。

果蠅全生命周期圖譜

期刊：Science

IF：56.9

時間：2023年5月

DOI：10.1126/science.adg0934

研究構(gòu)建了以單細(xì)胞核轉(zhuǎn)錄組為基礎(chǔ)的果蠅生長細(xì)胞圖譜（AFCA）。展現(xiàn)了雄性和雌性果蠅生命周期內(nèi)大多數(shù)組織的細(xì)胞水平的轉(zhuǎn)錄變化特征。提供了與年齡有關(guān)的基因表達(dá)變化、細(xì)胞組成的改變以及與衰老相關(guān)的共同途徑的新見解。

地中海渦蟲再生時空圖譜

期刊：Nature Communications

IF：16.6

時間：2023年6月

DOI：10.1038/s41467-023-39016-0

研究繪制了地中海渦蟲六個不同再生時期的空間轉(zhuǎn)錄組和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜。從時空圖譜中鑒定到了能影響再生效率的新生細(xì)胞亞型及多個創(chuàng)傷相關(guān)的具空間特征的表達(dá)模式。時空關(guān)聯(lián)分析表明plk1等多個基因的缺失會導(dǎo)致渦蟲的再生能力失效。